Protein–RNA interactions for Protein: Q60519

Sema5b, Semaphorin-5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5bQ60519 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sema5bQ60519 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms