Protein–RNA interactions for Protein: Q5XJY5

Arcn1, Coatomer subunit delta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arcn1Q5XJY5 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arcn1Q5XJY5 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arcn1Q5XJY5 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arcn1Q5XJY5 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arcn1Q5XJY5 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arcn1Q5XJY5 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arcn1Q5XJY5 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arcn1Q5XJY5 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arcn1Q5XJY5 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Arcn1Q5XJY5 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arcn1Q5XJY5 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Arcn1Q5XJY5 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arcn1Q5XJY5 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arcn1Q5XJY5 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arcn1Q5XJY5 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Arcn1Q5XJY5 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arcn1Q5XJY5 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arcn1Q5XJY5 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arcn1Q5XJY5 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arcn1Q5XJY5 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arcn1Q5XJY5 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Arcn1Q5XJY5 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Arcn1Q5XJY5 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Arcn1Q5XJY5 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Arcn1Q5XJY5 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Arcn1Q5XJY5 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arcn1Q5XJY5 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arcn1Q5XJY5 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arcn1Q5XJY5 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arcn1Q5XJY5 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arcn1Q5XJY5 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arcn1Q5XJY5 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arcn1Q5XJY5 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Arcn1Q5XJY5 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arcn1Q5XJY5 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arcn1Q5XJY5 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arcn1Q5XJY5 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arcn1Q5XJY5 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arcn1Q5XJY5 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arcn1Q5XJY5 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arcn1Q5XJY5 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arcn1Q5XJY5 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arcn1Q5XJY5 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms