Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim38Q5SZ99 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72 ms