Protein–RNA interactions for Protein: Q5SX40

Myh1, Myosin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh1Q5SX40 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Myh1Q5SX40 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Myh1Q5SX40 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Myh1Q5SX40 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Myh1Q5SX40 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Myh1Q5SX40 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Myh1Q5SX40 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Myh1Q5SX40 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Myh1Q5SX40 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Myh1Q5SX40 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Myh1Q5SX40 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Myh1Q5SX40 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Myh1Q5SX40 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Myh1Q5SX40 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Myh1Q5SX40 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Myh1Q5SX40 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Myh1Q5SX40 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Myh1Q5SX40 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Myh1Q5SX40 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Myh1Q5SX40 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Myh1Q5SX40 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Myh1Q5SX40 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Myh1Q5SX40 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Myh1Q5SX40 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Myh1Q5SX40 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Myh1Q5SX40 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Myh1Q5SX40 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Myh1Q5SX40 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Myh1Q5SX40 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Myh1Q5SX40 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Myh1Q5SX40 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Myh1Q5SX40 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Myh1Q5SX40 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Myh1Q5SX40 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Myh1Q5SX40 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Myh1Q5SX40 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Myh1Q5SX40 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Myh1Q5SX40 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Myh1Q5SX40 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Myh1Q5SX40 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Myh1Q5SX40 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Myh1Q5SX40 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Myh1Q5SX40 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Myh1Q5SX40 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Myh1Q5SX40 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Myh1Q5SX40 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Myh1Q5SX40 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Myh1Q5SX40 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Myh1Q5SX40 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Myh1Q5SX40 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Myh1Q5SX40 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Myh1Q5SX40 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Myh1Q5SX40 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Myh1Q5SX40 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Myh1Q5SX40 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Myh1Q5SX40 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Myh1Q5SX40 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Myh1Q5SX40 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Myh1Q5SX40 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Myh1Q5SX40 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Myh1Q5SX40 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Myh1Q5SX40 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Myh1Q5SX40 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Myh1Q5SX40 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Myh1Q5SX40 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Myh1Q5SX40 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Myh1Q5SX40 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Myh1Q5SX40 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Myh1Q5SX40 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Myh1Q5SX40 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Myh1Q5SX40 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Myh1Q5SX40 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Myh1Q5SX40 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Myh1Q5SX40 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Myh1Q5SX40 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Myh1Q5SX40 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Myh1Q5SX40 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Myh1Q5SX40 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Myh1Q5SX40 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Myh1Q5SX40 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Myh1Q5SX40 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Myh1Q5SX40 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Myh1Q5SX40 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Myh1Q5SX40 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Myh1Q5SX40 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms