Protein–RNA interactions for Protein: Q5STT6

Fam71b, Protein FAM71B, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71bQ5STT6 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam71bQ5STT6 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms