Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TefmQ5SSK3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TefmQ5SSK3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TefmQ5SSK3 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TefmQ5SSK3 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TefmQ5SSK3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TefmQ5SSK3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TefmQ5SSK3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TefmQ5SSK3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TefmQ5SSK3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TefmQ5SSK3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TefmQ5SSK3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TefmQ5SSK3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TefmQ5SSK3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TefmQ5SSK3 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TefmQ5SSK3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TefmQ5SSK3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TefmQ5SSK3 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TefmQ5SSK3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TefmQ5SSK3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms