Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A3

Trdv4, T cell receptor delta variable 4 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv4Q5R1A3 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trdv4Q5R1A3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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