Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND29

Rilp, Rab-interacting lysosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RilpQ5ND29 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms