Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND28

Scarf1, Scavenger receptor class F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf1Q5ND28 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scarf1Q5ND28 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scarf1Q5ND28 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scarf1Q5ND28 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scarf1Q5ND28 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scarf1Q5ND28 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scarf1Q5ND28 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scarf1Q5ND28 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scarf1Q5ND28 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Scarf1Q5ND28 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Scarf1Q5ND28 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scarf1Q5ND28 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scarf1Q5ND28 Gm43974-201ENSMUST00000205080 684 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Scarf1Q5ND28 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scarf1Q5ND28 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scarf1Q5ND28 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Scarf1Q5ND28 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scarf1Q5ND28 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scarf1Q5ND28 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scarf1Q5ND28 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scarf1Q5ND28 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scarf1Q5ND28 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scarf1Q5ND28 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scarf1Q5ND28 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scarf1Q5ND28 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scarf1Q5ND28 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scarf1Q5ND28 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scarf1Q5ND28 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scarf1Q5ND28 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scarf1Q5ND28 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scarf1Q5ND28 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scarf1Q5ND28 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scarf1Q5ND28 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scarf1Q5ND28 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scarf1Q5ND28 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scarf1Q5ND28 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Scarf1Q5ND28 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scarf1Q5ND28 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scarf1Q5ND28 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scarf1Q5ND28 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Scarf1Q5ND28 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scarf1Q5ND28 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scarf1Q5ND28 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scarf1Q5ND28 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Scarf1Q5ND28 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scarf1Q5ND28 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Scarf1Q5ND28 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scarf1Q5ND28 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scarf1Q5ND28 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scarf1Q5ND28 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scarf1Q5ND28 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scarf1Q5ND28 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scarf1Q5ND28 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scarf1Q5ND28 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scarf1Q5ND28 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scarf1Q5ND28 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scarf1Q5ND28 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scarf1Q5ND28 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scarf1Q5ND28 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Scarf1Q5ND28 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scarf1Q5ND28 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scarf1Q5ND28 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Scarf1Q5ND28 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scarf1Q5ND28 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scarf1Q5ND28 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scarf1Q5ND28 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scarf1Q5ND28 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scarf1Q5ND28 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scarf1Q5ND28 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scarf1Q5ND28 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scarf1Q5ND28 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scarf1Q5ND28 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scarf1Q5ND28 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scarf1Q5ND28 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scarf1Q5ND28 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scarf1Q5ND28 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scarf1Q5ND28 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scarf1Q5ND28 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scarf1Q5ND28 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scarf1Q5ND28 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scarf1Q5ND28 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scarf1Q5ND28 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scarf1Q5ND28 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scarf1Q5ND28 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scarf1Q5ND28 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scarf1Q5ND28 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scarf1Q5ND28 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Scarf1Q5ND28 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scarf1Q5ND28 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scarf1Q5ND28 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scarf1Q5ND28 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scarf1Q5ND28 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scarf1Q5ND28 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scarf1Q5ND28 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scarf1Q5ND28 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scarf1Q5ND28 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scarf1Q5ND28 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scarf1Q5ND28 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scarf1Q5ND28 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scarf1Q5ND28 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.5 ms