Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms