Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWH3

Grhl3, Grainyhead-like protein 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grhl3Q5FWH3 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grhl3Q5FWH3 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grhl3Q5FWH3 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Grhl3Q5FWH3 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Grhl3Q5FWH3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grhl3Q5FWH3 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Grhl3Q5FWH3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grhl3Q5FWH3 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grhl3Q5FWH3 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Grhl3Q5FWH3 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grhl3Q5FWH3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grhl3Q5FWH3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grhl3Q5FWH3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grhl3Q5FWH3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grhl3Q5FWH3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grhl3Q5FWH3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grhl3Q5FWH3 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Grhl3Q5FWH3 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Grhl3Q5FWH3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Grhl3Q5FWH3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Grhl3Q5FWH3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Grhl3Q5FWH3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Grhl3Q5FWH3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grhl3Q5FWH3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grhl3Q5FWH3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grhl3Q5FWH3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grhl3Q5FWH3 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grhl3Q5FWH3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grhl3Q5FWH3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grhl3Q5FWH3 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grhl3Q5FWH3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grhl3Q5FWH3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grhl3Q5FWH3 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grhl3Q5FWH3 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grhl3Q5FWH3 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Grhl3Q5FWH3 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grhl3Q5FWH3 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grhl3Q5FWH3 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grhl3Q5FWH3 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grhl3Q5FWH3 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Grhl3Q5FWH3 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grhl3Q5FWH3 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grhl3Q5FWH3 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grhl3Q5FWH3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grhl3Q5FWH3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grhl3Q5FWH3 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grhl3Q5FWH3 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grhl3Q5FWH3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grhl3Q5FWH3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Grhl3Q5FWH3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grhl3Q5FWH3 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grhl3Q5FWH3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grhl3Q5FWH3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grhl3Q5FWH3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grhl3Q5FWH3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grhl3Q5FWH3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grhl3Q5FWH3 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grhl3Q5FWH3 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grhl3Q5FWH3 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grhl3Q5FWH3 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grhl3Q5FWH3 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grhl3Q5FWH3 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Grhl3Q5FWH3 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grhl3Q5FWH3 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grhl3Q5FWH3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grhl3Q5FWH3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grhl3Q5FWH3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grhl3Q5FWH3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grhl3Q5FWH3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grhl3Q5FWH3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grhl3Q5FWH3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grhl3Q5FWH3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grhl3Q5FWH3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grhl3Q5FWH3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grhl3Q5FWH3 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Grhl3Q5FWH3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grhl3Q5FWH3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grhl3Q5FWH3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grhl3Q5FWH3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grhl3Q5FWH3 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grhl3Q5FWH3 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grhl3Q5FWH3 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grhl3Q5FWH3 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grhl3Q5FWH3 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grhl3Q5FWH3 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Grhl3Q5FWH3 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Grhl3Q5FWH3 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grhl3Q5FWH3 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grhl3Q5FWH3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grhl3Q5FWH3 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grhl3Q5FWH3 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grhl3Q5FWH3 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grhl3Q5FWH3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Grhl3Q5FWH3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grhl3Q5FWH3 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grhl3Q5FWH3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grhl3Q5FWH3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grhl3Q5FWH3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grhl3Q5FWH3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grhl3Q5FWH3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms