Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU31

Ipcef1, Interactor protein for cytohesin exchange factors 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ipcef1Q5DU31 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ipcef1Q5DU31 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ipcef1Q5DU31 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ipcef1Q5DU31 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ipcef1Q5DU31 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ipcef1Q5DU31 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ipcef1Q5DU31 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ipcef1Q5DU31 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ipcef1Q5DU31 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ipcef1Q5DU31 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ipcef1Q5DU31 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ipcef1Q5DU31 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ipcef1Q5DU31 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ipcef1Q5DU31 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ipcef1Q5DU31 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ipcef1Q5DU31 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ipcef1Q5DU31 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ipcef1Q5DU31 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ipcef1Q5DU31 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ipcef1Q5DU31 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ipcef1Q5DU31 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ipcef1Q5DU31 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ipcef1Q5DU31 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ipcef1Q5DU31 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ipcef1Q5DU31 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ipcef1Q5DU31 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ipcef1Q5DU31 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ipcef1Q5DU31 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ipcef1Q5DU31 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ipcef1Q5DU31 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ipcef1Q5DU31 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ipcef1Q5DU31 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ipcef1Q5DU31 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ipcef1Q5DU31 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ipcef1Q5DU31 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ipcef1Q5DU31 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ipcef1Q5DU31 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ipcef1Q5DU31 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ipcef1Q5DU31 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ipcef1Q5DU31 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ipcef1Q5DU31 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ipcef1Q5DU31 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ipcef1Q5DU31 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ipcef1Q5DU31 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ipcef1Q5DU31 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ipcef1Q5DU31 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ipcef1Q5DU31 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ipcef1Q5DU31 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ipcef1Q5DU31 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ipcef1Q5DU31 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ipcef1Q5DU31 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ipcef1Q5DU31 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ipcef1Q5DU31 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ipcef1Q5DU31 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ipcef1Q5DU31 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ipcef1Q5DU31 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ipcef1Q5DU31 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ipcef1Q5DU31 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ipcef1Q5DU31 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ipcef1Q5DU31 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ipcef1Q5DU31 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ipcef1Q5DU31 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ipcef1Q5DU31 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ipcef1Q5DU31 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ipcef1Q5DU31 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ipcef1Q5DU31 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ipcef1Q5DU31 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ipcef1Q5DU31 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ipcef1Q5DU31 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ipcef1Q5DU31 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ipcef1Q5DU31 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ipcef1Q5DU31 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ipcef1Q5DU31 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ipcef1Q5DU31 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ipcef1Q5DU31 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ipcef1Q5DU31 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ipcef1Q5DU31 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ipcef1Q5DU31 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ipcef1Q5DU31 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ipcef1Q5DU31 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ipcef1Q5DU31 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ipcef1Q5DU31 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ipcef1Q5DU31 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ipcef1Q5DU31 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ipcef1Q5DU31 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ipcef1Q5DU31 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ipcef1Q5DU31 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ipcef1Q5DU31 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ipcef1Q5DU31 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ipcef1Q5DU31 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ipcef1Q5DU31 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ipcef1Q5DU31 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ipcef1Q5DU31 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ipcef1Q5DU31 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ipcef1Q5DU31 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ipcef1Q5DU31 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ipcef1Q5DU31 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Ipcef1Q5DU31 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ipcef1Q5DU31 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ipcef1Q5DU31 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms