Protein–RNA interactions for Protein: Q5D525

Syce1l, Synaptonemal complex central element protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1lQ5D525 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Syce1lQ5D525 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Syce1lQ5D525 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Syce1lQ5D525 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Syce1lQ5D525 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Syce1lQ5D525 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Syce1lQ5D525 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Syce1lQ5D525 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syce1lQ5D525 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syce1lQ5D525 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syce1lQ5D525 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syce1lQ5D525 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syce1lQ5D525 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syce1lQ5D525 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syce1lQ5D525 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syce1lQ5D525 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syce1lQ5D525 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syce1lQ5D525 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syce1lQ5D525 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syce1lQ5D525 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syce1lQ5D525 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syce1lQ5D525 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syce1lQ5D525 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syce1lQ5D525 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syce1lQ5D525 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syce1lQ5D525 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syce1lQ5D525 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syce1lQ5D525 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syce1lQ5D525 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syce1lQ5D525 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syce1lQ5D525 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syce1lQ5D525 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syce1lQ5D525 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Syce1lQ5D525 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Syce1lQ5D525 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Syce1lQ5D525 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Syce1lQ5D525 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Syce1lQ5D525 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Syce1lQ5D525 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Syce1lQ5D525 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Syce1lQ5D525 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Syce1lQ5D525 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Syce1lQ5D525 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Syce1lQ5D525 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Syce1lQ5D525 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Syce1lQ5D525 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Syce1lQ5D525 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Syce1lQ5D525 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Syce1lQ5D525 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Syce1lQ5D525 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Syce1lQ5D525 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Syce1lQ5D525 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Syce1lQ5D525 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Syce1lQ5D525 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syce1lQ5D525 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syce1lQ5D525 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syce1lQ5D525 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syce1lQ5D525 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syce1lQ5D525 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syce1lQ5D525 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syce1lQ5D525 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syce1lQ5D525 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syce1lQ5D525 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syce1lQ5D525 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syce1lQ5D525 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syce1lQ5D525 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syce1lQ5D525 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syce1lQ5D525 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syce1lQ5D525 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Syce1lQ5D525 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syce1lQ5D525 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syce1lQ5D525 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syce1lQ5D525 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syce1lQ5D525 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syce1lQ5D525 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syce1lQ5D525 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syce1lQ5D525 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syce1lQ5D525 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syce1lQ5D525 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syce1lQ5D525 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syce1lQ5D525 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syce1lQ5D525 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syce1lQ5D525 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syce1lQ5D525 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syce1lQ5D525 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syce1lQ5D525 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syce1lQ5D525 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Syce1lQ5D525 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syce1lQ5D525 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syce1lQ5D525 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syce1lQ5D525 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syce1lQ5D525 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syce1lQ5D525 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syce1lQ5D525 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syce1lQ5D525 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syce1lQ5D525 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syce1lQ5D525 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syce1lQ5D525 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syce1lQ5D525 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syce1lQ5D525 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms