Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Spire1Q52KF3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms