Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms