Protein–RNA interactions for Protein: Q499D5

Zfp235, Zinc finger protein 235, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp235Q499D5 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp235Q499D5 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp235Q499D5 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp235Q499D5 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp235Q499D5 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp235Q499D5 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp235Q499D5 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp235Q499D5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp235Q499D5 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp235Q499D5 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp235Q499D5 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp235Q499D5 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp235Q499D5 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp235Q499D5 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp235Q499D5 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp235Q499D5 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp235Q499D5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp235Q499D5 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp235Q499D5 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp235Q499D5 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp235Q499D5 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp235Q499D5 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp235Q499D5 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp235Q499D5 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp235Q499D5 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp235Q499D5 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp235Q499D5 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp235Q499D5 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp235Q499D5 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp235Q499D5 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp235Q499D5 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp235Q499D5 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp235Q499D5 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp235Q499D5 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms