Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2al1nQ497L1 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2al1nQ497L1 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2al1nQ497L1 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2al1nQ497L1 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2al1nQ497L1 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2al1nQ497L1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2al1nQ497L1 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2al1nQ497L1 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2al1nQ497L1 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
H2al1nQ497L1 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
H2al1nQ497L1 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2al1nQ497L1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2al1nQ497L1 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2al1nQ497L1 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2al1nQ497L1 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2al1nQ497L1 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2al1nQ497L1 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2al1nQ497L1 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2al1nQ497L1 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2al1nQ497L1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2al1nQ497L1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2al1nQ497L1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2al1nQ497L1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2al1nQ497L1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2al1nQ497L1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2al1nQ497L1 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2al1nQ497L1 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2al1nQ497L1 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2al1nQ497L1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2al1nQ497L1 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2al1nQ497L1 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2al1nQ497L1 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2al1nQ497L1 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2al1nQ497L1 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2al1nQ497L1 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2al1nQ497L1 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2al1nQ497L1 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2al1nQ497L1 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2al1nQ497L1 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2al1nQ497L1 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2al1nQ497L1 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2al1nQ497L1 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2al1nQ497L1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2al1nQ497L1 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2al1nQ497L1 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al1nQ497L1 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al1nQ497L1 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al1nQ497L1 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al1nQ497L1 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al1nQ497L1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al1nQ497L1 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al1nQ497L1 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al1nQ497L1 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al1nQ497L1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al1nQ497L1 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al1nQ497L1 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al1nQ497L1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al1nQ497L1 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al1nQ497L1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al1nQ497L1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al1nQ497L1 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al1nQ497L1 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al1nQ497L1 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al1nQ497L1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al1nQ497L1 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al1nQ497L1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al1nQ497L1 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al1nQ497L1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al1nQ497L1 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al1nQ497L1 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al1nQ497L1 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al1nQ497L1 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al1nQ497L1 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al1nQ497L1 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al1nQ497L1 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al1nQ497L1 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al1nQ497L1 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al1nQ497L1 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al1nQ497L1 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al1nQ497L1 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al1nQ497L1 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al1nQ497L1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2al1nQ497L1 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
H2al1nQ497L1 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2al1nQ497L1 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2al1nQ497L1 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2al1nQ497L1 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2al1nQ497L1 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2al1nQ497L1 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
H2al1nQ497L1 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2al1nQ497L1 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2al1nQ497L1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2al1nQ497L1 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2al1nQ497L1 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2al1nQ497L1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2al1nQ497L1 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2al1nQ497L1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2al1nQ497L1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2al1nQ497L1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms