Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ckap2Q3V1H1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ckap2Q3V1H1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ckap2Q3V1H1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ckap2Q3V1H1 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ckap2Q3V1H1 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ckap2Q3V1H1 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ckap2Q3V1H1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ckap2Q3V1H1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ckap2Q3V1H1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ckap2Q3V1H1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ckap2Q3V1H1 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ckap2Q3V1H1 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ckap2Q3V1H1 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ckap2Q3V1H1 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ckap2Q3V1H1 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ckap2Q3V1H1 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ckap2Q3V1H1 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ckap2Q3V1H1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ckap2Q3V1H1 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ckap2Q3V1H1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ckap2Q3V1H1 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ckap2Q3V1H1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ckap2Q3V1H1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ckap2Q3V1H1 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ckap2Q3V1H1 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ckap2Q3V1H1 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ckap2Q3V1H1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ckap2Q3V1H1 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ckap2Q3V1H1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ckap2Q3V1H1 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ckap2Q3V1H1 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ckap2Q3V1H1 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ckap2Q3V1H1 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ckap2Q3V1H1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ckap2Q3V1H1 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ckap2Q3V1H1 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ckap2Q3V1H1 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ckap2Q3V1H1 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ckap2Q3V1H1 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ckap2Q3V1H1 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ckap2Q3V1H1 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ckap2Q3V1H1 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ckap2Q3V1H1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ckap2Q3V1H1 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ckap2Q3V1H1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ckap2Q3V1H1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ckap2Q3V1H1 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ckap2Q3V1H1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ckap2Q3V1H1 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ckap2Q3V1H1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ckap2Q3V1H1 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ckap2Q3V1H1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ckap2Q3V1H1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ckap2Q3V1H1 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ckap2Q3V1H1 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ckap2Q3V1H1 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ckap2Q3V1H1 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ckap2Q3V1H1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ckap2Q3V1H1 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ckap2Q3V1H1 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ckap2Q3V1H1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ckap2Q3V1H1 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ckap2Q3V1H1 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ckap2Q3V1H1 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ckap2Q3V1H1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ckap2Q3V1H1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ckap2Q3V1H1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ckap2Q3V1H1 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ckap2Q3V1H1 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ckap2Q3V1H1 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ckap2Q3V1H1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ckap2Q3V1H1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms