Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ulk4Q3V129 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ulk4Q3V129 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ulk4Q3V129 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ulk4Q3V129 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ulk4Q3V129 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ulk4Q3V129 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ulk4Q3V129 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ulk4Q3V129 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ulk4Q3V129 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ulk4Q3V129 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ulk4Q3V129 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ulk4Q3V129 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ulk4Q3V129 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ulk4Q3V129 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ulk4Q3V129 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ulk4Q3V129 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ulk4Q3V129 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ulk4Q3V129 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ulk4Q3V129 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ulk4Q3V129 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ulk4Q3V129 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ulk4Q3V129 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ulk4Q3V129 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ulk4Q3V129 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ulk4Q3V129 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ulk4Q3V129 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ulk4Q3V129 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ulk4Q3V129 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ulk4Q3V129 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ulk4Q3V129 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ulk4Q3V129 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ulk4Q3V129 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ulk4Q3V129 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ulk4Q3V129 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ulk4Q3V129 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ulk4Q3V129 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ulk4Q3V129 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ulk4Q3V129 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ulk4Q3V129 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ulk4Q3V129 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ulk4Q3V129 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ulk4Q3V129 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ulk4Q3V129 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ulk4Q3V129 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ulk4Q3V129 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ulk4Q3V129 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ulk4Q3V129 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ulk4Q3V129 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ulk4Q3V129 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ulk4Q3V129 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ulk4Q3V129 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ulk4Q3V129 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ulk4Q3V129 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ulk4Q3V129 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ulk4Q3V129 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ulk4Q3V129 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ulk4Q3V129 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ulk4Q3V129 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ulk4Q3V129 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ulk4Q3V129 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ulk4Q3V129 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ulk4Q3V129 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ulk4Q3V129 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ulk4Q3V129 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ulk4Q3V129 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ulk4Q3V129 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ulk4Q3V129 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ulk4Q3V129 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ulk4Q3V129 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ulk4Q3V129 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms