Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0X2

Cldn34b4, 4930428D18Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b4Q3V0X2 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn34b4Q3V0X2 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn34b4Q3V0X2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn34b4Q3V0X2 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34b4Q3V0X2 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34b4Q3V0X2 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34b4Q3V0X2 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34b4Q3V0X2 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34b4Q3V0X2 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms