Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Lrrc43Q3V0L5 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Lrrc43Q3V0L5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Lrrc43Q3V0L5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Lrrc43Q3V0L5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 Gm5244-202ENSMUST00000189517 743 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 Gm12813-201ENSMUST00000119615 902 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 B430010I23Rik-202ENSMUST00000152188 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrrc43Q3V0L5 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms