Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0H9

4930596D02Rik, RIKEN cDNA 4930596D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930596D02RikQ3V0H9 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
4930596D02RikQ3V0H9 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms