Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Prdm6Q3UZD5 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdm6Q3UZD5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdm6Q3UZD5 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Prdm6Q3UZD5 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Prdm6Q3UZD5 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdm6Q3UZD5 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Prdm6Q3UZD5 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdm6Q3UZD5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Prdm6Q3UZD5 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdm6Q3UZD5 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdm6Q3UZD5 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Prdm6Q3UZD5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdm6Q3UZD5 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Prdm6Q3UZD5 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdm6Q3UZD5 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Prdm6Q3UZD5 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdm6Q3UZD5 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdm6Q3UZD5 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdm6Q3UZD5 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdm6Q3UZD5 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdm6Q3UZD5 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdm6Q3UZD5 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdm6Q3UZD5 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdm6Q3UZD5 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdm6Q3UZD5 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdm6Q3UZD5 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdm6Q3UZD5 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdm6Q3UZD5 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdm6Q3UZD5 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdm6Q3UZD5 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdm6Q3UZD5 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdm6Q3UZD5 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdm6Q3UZD5 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdm6Q3UZD5 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms