Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kdm5aQ3UXZ9 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kdm5aQ3UXZ9 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kdm5aQ3UXZ9 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kdm5aQ3UXZ9 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kdm5aQ3UXZ9 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kdm5aQ3UXZ9 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Kdm5aQ3UXZ9 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kdm5aQ3UXZ9 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kdm5aQ3UXZ9 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kdm5aQ3UXZ9 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kdm5aQ3UXZ9 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kdm5aQ3UXZ9 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kdm5aQ3UXZ9 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kdm5aQ3UXZ9 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kdm5aQ3UXZ9 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Kdm5aQ3UXZ9 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Kdm5aQ3UXZ9 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Kdm5aQ3UXZ9 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Kdm5aQ3UXZ9 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kdm5aQ3UXZ9 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kdm5aQ3UXZ9 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kdm5aQ3UXZ9 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kdm5aQ3UXZ9 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kdm5aQ3UXZ9 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kdm5aQ3UXZ9 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kdm5aQ3UXZ9 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kdm5aQ3UXZ9 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kdm5aQ3UXZ9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kdm5aQ3UXZ9 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kdm5aQ3UXZ9 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kdm5aQ3UXZ9 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kdm5aQ3UXZ9 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kdm5aQ3UXZ9 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kdm5aQ3UXZ9 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kdm5aQ3UXZ9 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Kdm5aQ3UXZ9 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kdm5aQ3UXZ9 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kdm5aQ3UXZ9 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Kdm5aQ3UXZ9 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kdm5aQ3UXZ9 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kdm5aQ3UXZ9 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Kdm5aQ3UXZ9 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Kdm5aQ3UXZ9 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Kdm5aQ3UXZ9 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kdm5aQ3UXZ9 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Kdm5aQ3UXZ9 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Kdm5aQ3UXZ9 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kdm5aQ3UXZ9 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kdm5aQ3UXZ9 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kdm5aQ3UXZ9 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kdm5aQ3UXZ9 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kdm5aQ3UXZ9 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Kdm5aQ3UXZ9 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kdm5aQ3UXZ9 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kdm5aQ3UXZ9 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kdm5aQ3UXZ9 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kdm5aQ3UXZ9 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kdm5aQ3UXZ9 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kdm5aQ3UXZ9 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kdm5aQ3UXZ9 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kdm5aQ3UXZ9 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kdm5aQ3UXZ9 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kdm5aQ3UXZ9 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kdm5aQ3UXZ9 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Kdm5aQ3UXZ9 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kdm5aQ3UXZ9 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kdm5aQ3UXZ9 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Kdm5aQ3UXZ9 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kdm5aQ3UXZ9 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kdm5aQ3UXZ9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kdm5aQ3UXZ9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kdm5aQ3UXZ9 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kdm5aQ3UXZ9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kdm5aQ3UXZ9 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kdm5aQ3UXZ9 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kdm5aQ3UXZ9 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kdm5aQ3UXZ9 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Kdm5aQ3UXZ9 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kdm5aQ3UXZ9 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kdm5aQ3UXZ9 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Kdm5aQ3UXZ9 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Kdm5aQ3UXZ9 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kdm5aQ3UXZ9 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kdm5aQ3UXZ9 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Kdm5aQ3UXZ9 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Kdm5aQ3UXZ9 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kdm5aQ3UXZ9 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kdm5aQ3UXZ9 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kdm5aQ3UXZ9 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kdm5aQ3UXZ9 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kdm5aQ3UXZ9 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kdm5aQ3UXZ9 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kdm5aQ3UXZ9 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kdm5aQ3UXZ9 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kdm5aQ3UXZ9 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Kdm5aQ3UXZ9 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kdm5aQ3UXZ9 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kdm5aQ3UXZ9 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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