Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWX6

E330034G19Rik, RIKEN cDNA E330034G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330034G19RikQ3UWX6 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms