Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW22

Defb48, Beta-defensin 42, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb48Q3UW22 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defb48Q3UW22 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defb48Q3UW22 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defb48Q3UW22 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defb48Q3UW22 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defb48Q3UW22 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defb48Q3UW22 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defb48Q3UW22 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defb48Q3UW22 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defb48Q3UW22 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defb48Q3UW22 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defb48Q3UW22 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defb48Q3UW22 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defb48Q3UW22 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defb48Q3UW22 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defb48Q3UW22 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defb48Q3UW22 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defb48Q3UW22 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defb48Q3UW22 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defb48Q3UW22 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defb48Q3UW22 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defb48Q3UW22 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defb48Q3UW22 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defb48Q3UW22 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Defb48Q3UW22 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defb48Q3UW22 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defb48Q3UW22 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defb48Q3UW22 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Defb48Q3UW22 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Defb48Q3UW22 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defb48Q3UW22 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defb48Q3UW22 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defb48Q3UW22 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defb48Q3UW22 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defb48Q3UW22 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defb48Q3UW22 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defb48Q3UW22 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defb48Q3UW22 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defb48Q3UW22 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defb48Q3UW22 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defb48Q3UW22 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defb48Q3UW22 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defb48Q3UW22 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defb48Q3UW22 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defb48Q3UW22 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defb48Q3UW22 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defb48Q3UW22 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defb48Q3UW22 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defb48Q3UW22 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defb48Q3UW22 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defb48Q3UW22 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defb48Q3UW22 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defb48Q3UW22 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defb48Q3UW22 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defb48Q3UW22 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defb48Q3UW22 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defb48Q3UW22 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defb48Q3UW22 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defb48Q3UW22 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defb48Q3UW22 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defb48Q3UW22 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defb48Q3UW22 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defb48Q3UW22 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defb48Q3UW22 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defb48Q3UW22 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Defb48Q3UW22 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defb48Q3UW22 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms