Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV66

Slfn4, Schlafen 4, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn4Q3UV66 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slfn4Q3UV66 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms