Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV31

Rnf223, RING finger protein 223, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf223Q3UV31 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf223Q3UV31 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf223Q3UV31 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf223Q3UV31 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf223Q3UV31 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf223Q3UV31 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf223Q3UV31 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf223Q3UV31 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf223Q3UV31 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf223Q3UV31 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf223Q3UV31 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf223Q3UV31 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf223Q3UV31 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf223Q3UV31 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf223Q3UV31 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf223Q3UV31 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf223Q3UV31 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf223Q3UV31 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf223Q3UV31 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf223Q3UV31 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf223Q3UV31 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf223Q3UV31 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf223Q3UV31 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf223Q3UV31 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf223Q3UV31 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf223Q3UV31 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf223Q3UV31 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf223Q3UV31 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf223Q3UV31 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf223Q3UV31 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf223Q3UV31 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf223Q3UV31 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf223Q3UV31 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf223Q3UV31 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf223Q3UV31 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf223Q3UV31 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf223Q3UV31 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf223Q3UV31 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf223Q3UV31 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf223Q3UV31 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf223Q3UV31 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf223Q3UV31 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf223Q3UV31 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf223Q3UV31 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf223Q3UV31 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf223Q3UV31 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf223Q3UV31 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf223Q3UV31 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf223Q3UV31 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf223Q3UV31 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf223Q3UV31 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf223Q3UV31 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf223Q3UV31 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf223Q3UV31 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf223Q3UV31 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf223Q3UV31 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf223Q3UV31 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf223Q3UV31 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf223Q3UV31 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf223Q3UV31 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf223Q3UV31 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf223Q3UV31 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf223Q3UV31 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf223Q3UV31 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf223Q3UV31 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf223Q3UV31 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf223Q3UV31 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf223Q3UV31 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf223Q3UV31 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf223Q3UV31 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf223Q3UV31 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf223Q3UV31 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf223Q3UV31 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf223Q3UV31 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf223Q3UV31 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf223Q3UV31 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf223Q3UV31 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf223Q3UV31 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf223Q3UV31 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf223Q3UV31 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf223Q3UV31 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf223Q3UV31 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf223Q3UV31 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf223Q3UV31 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf223Q3UV31 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf223Q3UV31 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf223Q3UV31 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf223Q3UV31 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf223Q3UV31 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf223Q3UV31 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf223Q3UV31 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf223Q3UV31 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf223Q3UV31 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf223Q3UV31 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf223Q3UV31 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf223Q3UV31 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf223Q3UV31 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf223Q3UV31 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf223Q3UV31 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf223Q3UV31 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms