Protein–RNA interactions for Protein: Q3USZ2

Ubtfl1, Upstream-binding factor 1-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubtfl1Q3USZ2 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubtfl1Q3USZ2 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubtfl1Q3USZ2 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubtfl1Q3USZ2 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubtfl1Q3USZ2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubtfl1Q3USZ2 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubtfl1Q3USZ2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubtfl1Q3USZ2 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubtfl1Q3USZ2 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubtfl1Q3USZ2 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubtfl1Q3USZ2 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubtfl1Q3USZ2 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubtfl1Q3USZ2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubtfl1Q3USZ2 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubtfl1Q3USZ2 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubtfl1Q3USZ2 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubtfl1Q3USZ2 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubtfl1Q3USZ2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubtfl1Q3USZ2 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubtfl1Q3USZ2 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubtfl1Q3USZ2 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubtfl1Q3USZ2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubtfl1Q3USZ2 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubtfl1Q3USZ2 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubtfl1Q3USZ2 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubtfl1Q3USZ2 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubtfl1Q3USZ2 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubtfl1Q3USZ2 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubtfl1Q3USZ2 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubtfl1Q3USZ2 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubtfl1Q3USZ2 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubtfl1Q3USZ2 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubtfl1Q3USZ2 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubtfl1Q3USZ2 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubtfl1Q3USZ2 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubtfl1Q3USZ2 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubtfl1Q3USZ2 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubtfl1Q3USZ2 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubtfl1Q3USZ2 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubtfl1Q3USZ2 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubtfl1Q3USZ2 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubtfl1Q3USZ2 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubtfl1Q3USZ2 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubtfl1Q3USZ2 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubtfl1Q3USZ2 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubtfl1Q3USZ2 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubtfl1Q3USZ2 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubtfl1Q3USZ2 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubtfl1Q3USZ2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubtfl1Q3USZ2 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubtfl1Q3USZ2 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubtfl1Q3USZ2 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubtfl1Q3USZ2 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubtfl1Q3USZ2 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubtfl1Q3USZ2 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms