Protein–RNA interactions for Protein: Q3USW4

B230104I21Rik, RIKEN cDNA B230104I21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230104I21RikQ3USW4 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms