Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Znf48Q3US17 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Znf48Q3US17 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Znf48Q3US17 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Znf48Q3US17 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Znf48Q3US17 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Znf48Q3US17 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znf48Q3US17 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znf48Q3US17 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znf48Q3US17 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znf48Q3US17 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znf48Q3US17 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znf48Q3US17 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znf48Q3US17 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znf48Q3US17 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znf48Q3US17 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znf48Q3US17 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znf48Q3US17 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znf48Q3US17 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znf48Q3US17 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znf48Q3US17 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znf48Q3US17 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znf48Q3US17 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znf48Q3US17 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znf48Q3US17 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Znf48Q3US17 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znf48Q3US17 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znf48Q3US17 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znf48Q3US17 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znf48Q3US17 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znf48Q3US17 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znf48Q3US17 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Znf48Q3US17 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znf48Q3US17 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znf48Q3US17 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znf48Q3US17 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
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Znf48Q3US17 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Znf48Q3US17 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Znf48Q3US17 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Znf48Q3US17 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Znf48Q3US17 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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