Protein–RNA interactions for Protein: Q3US16

Tceanc, Transcription elongation factor A N-terminal and central domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TceancQ3US16 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TceancQ3US16 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TceancQ3US16 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TceancQ3US16 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TceancQ3US16 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TceancQ3US16 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TceancQ3US16 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TceancQ3US16 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TceancQ3US16 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TceancQ3US16 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TceancQ3US16 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TceancQ3US16 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TceancQ3US16 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TceancQ3US16 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TceancQ3US16 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TceancQ3US16 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TceancQ3US16 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TceancQ3US16 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TceancQ3US16 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TceancQ3US16 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TceancQ3US16 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TceancQ3US16 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TceancQ3US16 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TceancQ3US16 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TceancQ3US16 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TceancQ3US16 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TceancQ3US16 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms