Protein–RNA interactions for Protein: Q3URJ8

Nkain3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkain3Q3URJ8 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nkain3Q3URJ8 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nkain3Q3URJ8 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nkain3Q3URJ8 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nkain3Q3URJ8 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nkain3Q3URJ8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nkain3Q3URJ8 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nkain3Q3URJ8 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nkain3Q3URJ8 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nkain3Q3URJ8 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nkain3Q3URJ8 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nkain3Q3URJ8 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Nkain3Q3URJ8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nkain3Q3URJ8 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nkain3Q3URJ8 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nkain3Q3URJ8 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nkain3Q3URJ8 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nkain3Q3URJ8 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nkain3Q3URJ8 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nkain3Q3URJ8 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nkain3Q3URJ8 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nkain3Q3URJ8 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nkain3Q3URJ8 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nkain3Q3URJ8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Nkain3Q3URJ8 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nkain3Q3URJ8 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nkain3Q3URJ8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nkain3Q3URJ8 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nkain3Q3URJ8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nkain3Q3URJ8 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nkain3Q3URJ8 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Nkain3Q3URJ8 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nkain3Q3URJ8 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nkain3Q3URJ8 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nkain3Q3URJ8 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nkain3Q3URJ8 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nkain3Q3URJ8 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nkain3Q3URJ8 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Nkain3Q3URJ8 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nkain3Q3URJ8 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nkain3Q3URJ8 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nkain3Q3URJ8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nkain3Q3URJ8 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nkain3Q3URJ8 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nkain3Q3URJ8 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nkain3Q3URJ8 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nkain3Q3URJ8 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nkain3Q3URJ8 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Nkain3Q3URJ8 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nkain3Q3URJ8 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nkain3Q3URJ8 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Nkain3Q3URJ8 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Nkain3Q3URJ8 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Nkain3Q3URJ8 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nkain3Q3URJ8 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Nkain3Q3URJ8 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nkain3Q3URJ8 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nkain3Q3URJ8 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Nkain3Q3URJ8 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nkain3Q3URJ8 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nkain3Q3URJ8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nkain3Q3URJ8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nkain3Q3URJ8 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nkain3Q3URJ8 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nkain3Q3URJ8 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nkain3Q3URJ8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nkain3Q3URJ8 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nkain3Q3URJ8 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nkain3Q3URJ8 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nkain3Q3URJ8 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Nkain3Q3URJ8 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nkain3Q3URJ8 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nkain3Q3URJ8 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nkain3Q3URJ8 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nkain3Q3URJ8 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nkain3Q3URJ8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nkain3Q3URJ8 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nkain3Q3URJ8 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nkain3Q3URJ8 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nkain3Q3URJ8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Nkain3Q3URJ8 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms