Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQ97

Gm5460, Predicted gene 5460, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5460Q3UQ97 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Gm5460Q3UQ97 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5460Q3UQ97 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5460Q3UQ97 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5460Q3UQ97 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5460Q3UQ97 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5460Q3UQ97 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5460Q3UQ97 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5460Q3UQ97 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5460Q3UQ97 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5460Q3UQ97 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5460Q3UQ97 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5460Q3UQ97 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5460Q3UQ97 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5460Q3UQ97 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5460Q3UQ97 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5460Q3UQ97 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5460Q3UQ97 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5460Q3UQ97 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5460Q3UQ97 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5460Q3UQ97 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5460Q3UQ97 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5460Q3UQ97 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5460Q3UQ97 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5460Q3UQ97 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5460Q3UQ97 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5460Q3UQ97 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5460Q3UQ97 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5460Q3UQ97 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5460Q3UQ97 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5460Q3UQ97 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5460Q3UQ97 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5460Q3UQ97 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5460Q3UQ97 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Gm5460Q3UQ97 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5460Q3UQ97 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5460Q3UQ97 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5460Q3UQ97 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5460Q3UQ97 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Gm5460Q3UQ97 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5460Q3UQ97 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5460Q3UQ97 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5460Q3UQ97 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5460Q3UQ97 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5460Q3UQ97 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5460Q3UQ97 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5460Q3UQ97 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5460Q3UQ97 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5460Q3UQ97 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5460Q3UQ97 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5460Q3UQ97 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5460Q3UQ97 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5460Q3UQ97 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5460Q3UQ97 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Gm5460Q3UQ97 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Gm5460Q3UQ97 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5460Q3UQ97 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5460Q3UQ97 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5460Q3UQ97 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5460Q3UQ97 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5460Q3UQ97 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Gm5460Q3UQ97 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5460Q3UQ97 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5460Q3UQ97 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5460Q3UQ97 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5460Q3UQ97 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5460Q3UQ97 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5460Q3UQ97 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5460Q3UQ97 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5460Q3UQ97 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5460Q3UQ97 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5460Q3UQ97 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5460Q3UQ97 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5460Q3UQ97 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5460Q3UQ97 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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