Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Nhlrc4Q3UP44 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nhlrc4Q3UP44 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nhlrc4Q3UP44 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nhlrc4Q3UP44 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nhlrc4Q3UP44 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nhlrc4Q3UP44 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nhlrc4Q3UP44 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nhlrc4Q3UP44 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nhlrc4Q3UP44 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nhlrc4Q3UP44 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nhlrc4Q3UP44 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nhlrc4Q3UP44 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nhlrc4Q3UP44 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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