Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Tmem253Q3UNB8 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Tmem253Q3UNB8 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Tmem253Q3UNB8 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Tmem253Q3UNB8 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Tmem253Q3UNB8 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Tmem253Q3UNB8 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Tmem253Q3UNB8 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tmem253Q3UNB8 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tmem253Q3UNB8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tmem253Q3UNB8 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tmem253Q3UNB8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tmem253Q3UNB8 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tmem253Q3UNB8 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tmem253Q3UNB8 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tmem253Q3UNB8 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tmem253Q3UNB8 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tmem253Q3UNB8 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tmem253Q3UNB8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tmem253Q3UNB8 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tmem253Q3UNB8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Tmem253Q3UNB8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tmem253Q3UNB8 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tmem253Q3UNB8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tmem253Q3UNB8 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tmem253Q3UNB8 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Tmem253Q3UNB8 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tmem253Q3UNB8 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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Tmem253Q3UNB8 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tmem253Q3UNB8 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tmem253Q3UNB8 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tmem253Q3UNB8 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tmem253Q3UNB8 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tmem253Q3UNB8 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tmem253Q3UNB8 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tmem253Q3UNB8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tmem253Q3UNB8 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tmem253Q3UNB8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tmem253Q3UNB8 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Tmem253Q3UNB8 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Tmem253Q3UNB8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tmem253Q3UNB8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tmem253Q3UNB8 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tmem253Q3UNB8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tmem253Q3UNB8 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tmem253Q3UNB8 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tmem253Q3UNB8 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tmem253Q3UNB8 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tmem253Q3UNB8 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tmem253Q3UNB8 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tmem253Q3UNB8 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Tmem253Q3UNB8 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tmem253Q3UNB8 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tmem253Q3UNB8 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tmem253Q3UNB8 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tmem253Q3UNB8 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tmem253Q3UNB8 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
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