Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms