Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKJ7

Smu1, WD40 repeat-containing protein SMU1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 513 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smu1Q3UKJ7 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smu1Q3UKJ7 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smu1Q3UKJ7 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smu1Q3UKJ7 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smu1Q3UKJ7 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smu1Q3UKJ7 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smu1Q3UKJ7 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smu1Q3UKJ7 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smu1Q3UKJ7 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smu1Q3UKJ7 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smu1Q3UKJ7 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smu1Q3UKJ7 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smu1Q3UKJ7 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smu1Q3UKJ7 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smu1Q3UKJ7 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smu1Q3UKJ7 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smu1Q3UKJ7 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smu1Q3UKJ7 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smu1Q3UKJ7 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smu1Q3UKJ7 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smu1Q3UKJ7 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smu1Q3UKJ7 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smu1Q3UKJ7 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smu1Q3UKJ7 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smu1Q3UKJ7 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smu1Q3UKJ7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smu1Q3UKJ7 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smu1Q3UKJ7 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smu1Q3UKJ7 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Smu1Q3UKJ7 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smu1Q3UKJ7 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smu1Q3UKJ7 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smu1Q3UKJ7 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smu1Q3UKJ7 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smu1Q3UKJ7 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smu1Q3UKJ7 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smu1Q3UKJ7 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smu1Q3UKJ7 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smu1Q3UKJ7 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smu1Q3UKJ7 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smu1Q3UKJ7 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smu1Q3UKJ7 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smu1Q3UKJ7 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smu1Q3UKJ7 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smu1Q3UKJ7 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smu1Q3UKJ7 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smu1Q3UKJ7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smu1Q3UKJ7 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smu1Q3UKJ7 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smu1Q3UKJ7 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smu1Q3UKJ7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Smu1Q3UKJ7 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smu1Q3UKJ7 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Smu1Q3UKJ7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smu1Q3UKJ7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smu1Q3UKJ7 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smu1Q3UKJ7 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smu1Q3UKJ7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smu1Q3UKJ7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smu1Q3UKJ7 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smu1Q3UKJ7 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smu1Q3UKJ7 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smu1Q3UKJ7 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smu1Q3UKJ7 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Smu1Q3UKJ7 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smu1Q3UKJ7 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smu1Q3UKJ7 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smu1Q3UKJ7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smu1Q3UKJ7 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smu1Q3UKJ7 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smu1Q3UKJ7 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smu1Q3UKJ7 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smu1Q3UKJ7 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smu1Q3UKJ7 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smu1Q3UKJ7 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smu1Q3UKJ7 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smu1Q3UKJ7 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smu1Q3UKJ7 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smu1Q3UKJ7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smu1Q3UKJ7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smu1Q3UKJ7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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