Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

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Length 1,360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp19Q3UJD6 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp19Q3UJD6 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp19Q3UJD6 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp19Q3UJD6 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp19Q3UJD6 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp19Q3UJD6 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp19Q3UJD6 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp19Q3UJD6 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp19Q3UJD6 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp19Q3UJD6 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp19Q3UJD6 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp19Q3UJD6 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp19Q3UJD6 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp19Q3UJD6 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp19Q3UJD6 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp19Q3UJD6 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp19Q3UJD6 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp19Q3UJD6 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp19Q3UJD6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp19Q3UJD6 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp19Q3UJD6 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp19Q3UJD6 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp19Q3UJD6 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp19Q3UJD6 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp19Q3UJD6 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp19Q3UJD6 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp19Q3UJD6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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Usp19Q3UJD6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp19Q3UJD6 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp19Q3UJD6 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp19Q3UJD6 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp19Q3UJD6 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp19Q3UJD6 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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Usp19Q3UJD6 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
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Usp19Q3UJD6 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp19Q3UJD6 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp19Q3UJD6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp19Q3UJD6 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp19Q3UJD6 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp19Q3UJD6 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
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Usp19Q3UJD6 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
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Usp19Q3UJD6 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
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Usp19Q3UJD6 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
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Usp19Q3UJD6 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms