Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB9

Edc4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edc4Q3UJB9 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Edc4Q3UJB9 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Edc4Q3UJB9 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Edc4Q3UJB9 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Edc4Q3UJB9 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Edc4Q3UJB9 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Edc4Q3UJB9 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Edc4Q3UJB9 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Edc4Q3UJB9 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Edc4Q3UJB9 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Edc4Q3UJB9 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Edc4Q3UJB9 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Edc4Q3UJB9 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Edc4Q3UJB9 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Edc4Q3UJB9 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Edc4Q3UJB9 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Edc4Q3UJB9 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Edc4Q3UJB9 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Edc4Q3UJB9 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Edc4Q3UJB9 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Edc4Q3UJB9 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Edc4Q3UJB9 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Edc4Q3UJB9 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Edc4Q3UJB9 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Edc4Q3UJB9 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Edc4Q3UJB9 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Edc4Q3UJB9 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Edc4Q3UJB9 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Edc4Q3UJB9 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Edc4Q3UJB9 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Edc4Q3UJB9 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Edc4Q3UJB9 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Edc4Q3UJB9 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Edc4Q3UJB9 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Edc4Q3UJB9 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Edc4Q3UJB9 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Edc4Q3UJB9 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Edc4Q3UJB9 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Edc4Q3UJB9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Edc4Q3UJB9 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Edc4Q3UJB9 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Edc4Q3UJB9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Edc4Q3UJB9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Edc4Q3UJB9 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Edc4Q3UJB9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Edc4Q3UJB9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Edc4Q3UJB9 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Edc4Q3UJB9 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Edc4Q3UJB9 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Edc4Q3UJB9 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Edc4Q3UJB9 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Edc4Q3UJB9 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Edc4Q3UJB9 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Edc4Q3UJB9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Edc4Q3UJB9 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Edc4Q3UJB9 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Edc4Q3UJB9 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Edc4Q3UJB9 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Edc4Q3UJB9 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Edc4Q3UJB9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Edc4Q3UJB9 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Edc4Q3UJB9 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Edc4Q3UJB9 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Edc4Q3UJB9 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Edc4Q3UJB9 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Edc4Q3UJB9 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Edc4Q3UJB9 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Edc4Q3UJB9 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Edc4Q3UJB9 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Edc4Q3UJB9 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Edc4Q3UJB9 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Edc4Q3UJB9 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Edc4Q3UJB9 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Edc4Q3UJB9 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Edc4Q3UJB9 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Edc4Q3UJB9 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Edc4Q3UJB9 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Edc4Q3UJB9 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Edc4Q3UJB9 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Edc4Q3UJB9 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Edc4Q3UJB9 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Edc4Q3UJB9 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Edc4Q3UJB9 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Edc4Q3UJB9 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Edc4Q3UJB9 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Edc4Q3UJB9 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Edc4Q3UJB9 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Edc4Q3UJB9 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Edc4Q3UJB9 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Edc4Q3UJB9 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Edc4Q3UJB9 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Edc4Q3UJB9 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Edc4Q3UJB9 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Edc4Q3UJB9 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Edc4Q3UJB9 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Edc4Q3UJB9 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Edc4Q3UJB9 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Edc4Q3UJB9 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Edc4Q3UJB9 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Edc4Q3UJB9 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms