Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHG7

Lchn, Protein LCHN, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LchnQ3UHG7 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms