Protein–RNA interactions for Protein: Q3UH93

Plxnd1, Plexin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 1,925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxnd1Q3UH93 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Plxnd1Q3UH93 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Plxnd1Q3UH93 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Plxnd1Q3UH93 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Plxnd1Q3UH93 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Plxnd1Q3UH93 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Plxnd1Q3UH93 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Plxnd1Q3UH93 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Plxnd1Q3UH93 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Plxnd1Q3UH93 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Plxnd1Q3UH93 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Plxnd1Q3UH93 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plxnd1Q3UH93 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plxnd1Q3UH93 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plxnd1Q3UH93 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plxnd1Q3UH93 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Plxnd1Q3UH93 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plxnd1Q3UH93 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Plxnd1Q3UH93 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plxnd1Q3UH93 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plxnd1Q3UH93 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plxnd1Q3UH93 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plxnd1Q3UH93 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plxnd1Q3UH93 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plxnd1Q3UH93 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plxnd1Q3UH93 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plxnd1Q3UH93 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plxnd1Q3UH93 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plxnd1Q3UH93 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plxnd1Q3UH93 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plxnd1Q3UH93 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plxnd1Q3UH93 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plxnd1Q3UH93 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Plxnd1Q3UH93 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plxnd1Q3UH93 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plxnd1Q3UH93 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plxnd1Q3UH93 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plxnd1Q3UH93 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plxnd1Q3UH93 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plxnd1Q3UH93 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plxnd1Q3UH93 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plxnd1Q3UH93 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plxnd1Q3UH93 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plxnd1Q3UH93 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plxnd1Q3UH93 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plxnd1Q3UH93 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plxnd1Q3UH93 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plxnd1Q3UH93 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plxnd1Q3UH93 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plxnd1Q3UH93 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plxnd1Q3UH93 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plxnd1Q3UH93 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plxnd1Q3UH93 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plxnd1Q3UH93 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plxnd1Q3UH93 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plxnd1Q3UH93 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plxnd1Q3UH93 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plxnd1Q3UH93 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plxnd1Q3UH93 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Plxnd1Q3UH93 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Plxnd1Q3UH93 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plxnd1Q3UH93 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plxnd1Q3UH93 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plxnd1Q3UH93 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plxnd1Q3UH93 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Plxnd1Q3UH93 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plxnd1Q3UH93 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plxnd1Q3UH93 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plxnd1Q3UH93 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plxnd1Q3UH93 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plxnd1Q3UH93 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Plxnd1Q3UH93 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plxnd1Q3UH93 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plxnd1Q3UH93 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plxnd1Q3UH93 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plxnd1Q3UH93 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plxnd1Q3UH93 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plxnd1Q3UH93 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plxnd1Q3UH93 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plxnd1Q3UH93 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plxnd1Q3UH93 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plxnd1Q3UH93 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Plxnd1Q3UH93 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Plxnd1Q3UH93 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plxnd1Q3UH93 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plxnd1Q3UH93 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plxnd1Q3UH93 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Plxnd1Q3UH93 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plxnd1Q3UH93 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plxnd1Q3UH93 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plxnd1Q3UH93 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plxnd1Q3UH93 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plxnd1Q3UH93 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plxnd1Q3UH93 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plxnd1Q3UH93 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Plxnd1Q3UH93 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plxnd1Q3UH93 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plxnd1Q3UH93 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plxnd1Q3UH93 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plxnd1Q3UH93 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133.6 ms