Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGP9

Lrrc58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc58Q3UGP9 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrrc58Q3UGP9 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc58Q3UGP9 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.7 ms