Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9G9

Lbr, Lamin-B receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LbrQ3U9G9 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LbrQ3U9G9 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LbrQ3U9G9 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LbrQ3U9G9 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LbrQ3U9G9 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LbrQ3U9G9 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LbrQ3U9G9 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LbrQ3U9G9 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LbrQ3U9G9 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LbrQ3U9G9 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LbrQ3U9G9 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LbrQ3U9G9 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LbrQ3U9G9 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LbrQ3U9G9 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LbrQ3U9G9 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LbrQ3U9G9 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LbrQ3U9G9 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LbrQ3U9G9 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LbrQ3U9G9 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LbrQ3U9G9 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LbrQ3U9G9 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LbrQ3U9G9 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LbrQ3U9G9 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LbrQ3U9G9 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LbrQ3U9G9 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LbrQ3U9G9 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LbrQ3U9G9 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LbrQ3U9G9 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LbrQ3U9G9 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LbrQ3U9G9 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LbrQ3U9G9 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LbrQ3U9G9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LbrQ3U9G9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LbrQ3U9G9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LbrQ3U9G9 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LbrQ3U9G9 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LbrQ3U9G9 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LbrQ3U9G9 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LbrQ3U9G9 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LbrQ3U9G9 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LbrQ3U9G9 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LbrQ3U9G9 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LbrQ3U9G9 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LbrQ3U9G9 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LbrQ3U9G9 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LbrQ3U9G9 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LbrQ3U9G9 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LbrQ3U9G9 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LbrQ3U9G9 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LbrQ3U9G9 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LbrQ3U9G9 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LbrQ3U9G9 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LbrQ3U9G9 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LbrQ3U9G9 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LbrQ3U9G9 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LbrQ3U9G9 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LbrQ3U9G9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LbrQ3U9G9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LbrQ3U9G9 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LbrQ3U9G9 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LbrQ3U9G9 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LbrQ3U9G9 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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