Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3C9

Gse1, Genetic suppressor element 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gse1Q3U3C9 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gse1Q3U3C9 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms