Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1F9

Pag1, Phosphoprotein associated with glycosphingolipid-enriched microdomains 1, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pag1Q3U1F9 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms