Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc136Q3TVA9 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc136Q3TVA9 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc136Q3TVA9 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc136Q3TVA9 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc136Q3TVA9 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc136Q3TVA9 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc136Q3TVA9 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc136Q3TVA9 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc136Q3TVA9 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc136Q3TVA9 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc136Q3TVA9 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc136Q3TVA9 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc136Q3TVA9 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc136Q3TVA9 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc136Q3TVA9 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc136Q3TVA9 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc136Q3TVA9 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc136Q3TVA9 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc136Q3TVA9 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc136Q3TVA9 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc136Q3TVA9 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc136Q3TVA9 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc136Q3TVA9 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc136Q3TVA9 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc136Q3TVA9 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc136Q3TVA9 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc136Q3TVA9 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc136Q3TVA9 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc136Q3TVA9 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc136Q3TVA9 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc136Q3TVA9 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc136Q3TVA9 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc136Q3TVA9 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc136Q3TVA9 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc136Q3TVA9 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc136Q3TVA9 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc136Q3TVA9 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc136Q3TVA9 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc136Q3TVA9 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc136Q3TVA9 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc136Q3TVA9 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc136Q3TVA9 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc136Q3TVA9 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc136Q3TVA9 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc136Q3TVA9 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc136Q3TVA9 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc136Q3TVA9 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc136Q3TVA9 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc136Q3TVA9 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc136Q3TVA9 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc136Q3TVA9 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc136Q3TVA9 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc136Q3TVA9 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc136Q3TVA9 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc136Q3TVA9 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc136Q3TVA9 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc136Q3TVA9 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc136Q3TVA9 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc136Q3TVA9 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc136Q3TVA9 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc136Q3TVA9 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc136Q3TVA9 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc136Q3TVA9 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc136Q3TVA9 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc136Q3TVA9 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc136Q3TVA9 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc136Q3TVA9 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc136Q3TVA9 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc136Q3TVA9 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc136Q3TVA9 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc136Q3TVA9 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc136Q3TVA9 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc136Q3TVA9 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc136Q3TVA9 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc136Q3TVA9 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc136Q3TVA9 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc136Q3TVA9 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc136Q3TVA9 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc136Q3TVA9 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc136Q3TVA9 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc136Q3TVA9 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc136Q3TVA9 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc136Q3TVA9 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc136Q3TVA9 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc136Q3TVA9 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc136Q3TVA9 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc136Q3TVA9 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc136Q3TVA9 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc136Q3TVA9 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc136Q3TVA9 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc136Q3TVA9 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc136Q3TVA9 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc136Q3TVA9 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc136Q3TVA9 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc136Q3TVA9 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc136Q3TVA9 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc136Q3TVA9 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc136Q3TVA9 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc136Q3TVA9 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms