Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTY5

Krt2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt2Q3TTY5 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Krt2Q3TTY5 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt2Q3TTY5 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt2Q3TTY5 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt2Q3TTY5 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt2Q3TTY5 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt2Q3TTY5 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt2Q3TTY5 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt2Q3TTY5 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt2Q3TTY5 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt2Q3TTY5 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt2Q3TTY5 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt2Q3TTY5 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt2Q3TTY5 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt2Q3TTY5 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt2Q3TTY5 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt2Q3TTY5 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt2Q3TTY5 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt2Q3TTY5 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt2Q3TTY5 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt2Q3TTY5 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt2Q3TTY5 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt2Q3TTY5 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt2Q3TTY5 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt2Q3TTY5 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt2Q3TTY5 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt2Q3TTY5 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt2Q3TTY5 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt2Q3TTY5 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt2Q3TTY5 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt2Q3TTY5 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt2Q3TTY5 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt2Q3TTY5 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt2Q3TTY5 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt2Q3TTY5 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt2Q3TTY5 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt2Q3TTY5 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt2Q3TTY5 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt2Q3TTY5 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt2Q3TTY5 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt2Q3TTY5 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt2Q3TTY5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt2Q3TTY5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt2Q3TTY5 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt2Q3TTY5 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt2Q3TTY5 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt2Q3TTY5 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt2Q3TTY5 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt2Q3TTY5 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt2Q3TTY5 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt2Q3TTY5 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt2Q3TTY5 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt2Q3TTY5 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt2Q3TTY5 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt2Q3TTY5 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt2Q3TTY5 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt2Q3TTY5 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt2Q3TTY5 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt2Q3TTY5 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt2Q3TTY5 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt2Q3TTY5 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt2Q3TTY5 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt2Q3TTY5 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt2Q3TTY5 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt2Q3TTY5 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt2Q3TTY5 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt2Q3TTY5 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms