Protein–RNA interactions for Protein: Q3TAP4

Ap5b1, AP-5 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap5b1Q3TAP4 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ap5b1Q3TAP4 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ap5b1Q3TAP4 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ap5b1Q3TAP4 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ap5b1Q3TAP4 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ap5b1Q3TAP4 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ap5b1Q3TAP4 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Ap5b1Q3TAP4 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap5b1Q3TAP4 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap5b1Q3TAP4 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap5b1Q3TAP4 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap5b1Q3TAP4 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap5b1Q3TAP4 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap5b1Q3TAP4 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap5b1Q3TAP4 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap5b1Q3TAP4 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap5b1Q3TAP4 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap5b1Q3TAP4 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap5b1Q3TAP4 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap5b1Q3TAP4 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap5b1Q3TAP4 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap5b1Q3TAP4 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap5b1Q3TAP4 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap5b1Q3TAP4 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap5b1Q3TAP4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap5b1Q3TAP4 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap5b1Q3TAP4 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap5b1Q3TAP4 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap5b1Q3TAP4 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap5b1Q3TAP4 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap5b1Q3TAP4 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap5b1Q3TAP4 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap5b1Q3TAP4 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap5b1Q3TAP4 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap5b1Q3TAP4 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap5b1Q3TAP4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap5b1Q3TAP4 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap5b1Q3TAP4 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap5b1Q3TAP4 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap5b1Q3TAP4 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap5b1Q3TAP4 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap5b1Q3TAP4 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap5b1Q3TAP4 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap5b1Q3TAP4 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap5b1Q3TAP4 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap5b1Q3TAP4 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap5b1Q3TAP4 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap5b1Q3TAP4 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap5b1Q3TAP4 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap5b1Q3TAP4 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap5b1Q3TAP4 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap5b1Q3TAP4 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap5b1Q3TAP4 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap5b1Q3TAP4 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap5b1Q3TAP4 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap5b1Q3TAP4 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap5b1Q3TAP4 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap5b1Q3TAP4 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap5b1Q3TAP4 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap5b1Q3TAP4 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap5b1Q3TAP4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap5b1Q3TAP4 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap5b1Q3TAP4 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap5b1Q3TAP4 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap5b1Q3TAP4 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap5b1Q3TAP4 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap5b1Q3TAP4 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap5b1Q3TAP4 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap5b1Q3TAP4 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap5b1Q3TAP4 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap5b1Q3TAP4 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap5b1Q3TAP4 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap5b1Q3TAP4 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap5b1Q3TAP4 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap5b1Q3TAP4 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap5b1Q3TAP4 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap5b1Q3TAP4 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap5b1Q3TAP4 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap5b1Q3TAP4 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap5b1Q3TAP4 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap5b1Q3TAP4 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap5b1Q3TAP4 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap5b1Q3TAP4 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap5b1Q3TAP4 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap5b1Q3TAP4 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap5b1Q3TAP4 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap5b1Q3TAP4 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap5b1Q3TAP4 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap5b1Q3TAP4 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap5b1Q3TAP4 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap5b1Q3TAP4 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap5b1Q3TAP4 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap5b1Q3TAP4 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap5b1Q3TAP4 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap5b1Q3TAP4 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap5b1Q3TAP4 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap5b1Q3TAP4 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap5b1Q3TAP4 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap5b1Q3TAP4 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap5b1Q3TAP4 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms