Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXB8

Colec11, Collectin-11, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec11Q3SXB8 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Colec11Q3SXB8 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Colec11Q3SXB8 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Colec11Q3SXB8 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Colec11Q3SXB8 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Colec11Q3SXB8 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Colec11Q3SXB8 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Colec11Q3SXB8 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Colec11Q3SXB8 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Colec11Q3SXB8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Colec11Q3SXB8 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Colec11Q3SXB8 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Colec11Q3SXB8 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Colec11Q3SXB8 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Colec11Q3SXB8 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Colec11Q3SXB8 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Colec11Q3SXB8 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Colec11Q3SXB8 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Colec11Q3SXB8 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Colec11Q3SXB8 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Colec11Q3SXB8 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Colec11Q3SXB8 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Colec11Q3SXB8 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Colec11Q3SXB8 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Colec11Q3SXB8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Colec11Q3SXB8 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Colec11Q3SXB8 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Colec11Q3SXB8 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Colec11Q3SXB8 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Colec11Q3SXB8 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Colec11Q3SXB8 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Colec11Q3SXB8 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Colec11Q3SXB8 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Colec11Q3SXB8 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
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Colec11Q3SXB8 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Colec11Q3SXB8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Colec11Q3SXB8 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Colec11Q3SXB8 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Colec11Q3SXB8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Colec11Q3SXB8 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Colec11Q3SXB8 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Colec11Q3SXB8 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Colec11Q3SXB8 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Colec11Q3SXB8 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Colec11Q3SXB8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Colec11Q3SXB8 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Colec11Q3SXB8 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Colec11Q3SXB8 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Colec11Q3SXB8 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Colec11Q3SXB8 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Colec11Q3SXB8 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Colec11Q3SXB8 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Colec11Q3SXB8 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Colec11Q3SXB8 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Colec11Q3SXB8 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Colec11Q3SXB8 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Colec11Q3SXB8 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Colec11Q3SXB8 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Colec11Q3SXB8 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Colec11Q3SXB8 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Colec11Q3SXB8 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Colec11Q3SXB8 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Colec11Q3SXB8 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Colec11Q3SXB8 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Colec11Q3SXB8 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Colec11Q3SXB8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Colec11Q3SXB8 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Colec11Q3SXB8 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Colec11Q3SXB8 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Colec11Q3SXB8 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Colec11Q3SXB8 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Colec11Q3SXB8 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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